Variação molecular de genes associados a lipoxigenases em grãos de variedades comerciais de soja mexicana

• Mónica López Laboratorio de Biotecnología Vegetal, Centro de Biotecnología Genómica, Instituto Politécnico Nacional, Reynosa, Tamaulipas, México https://orcid.org/0000-0002-3921-4335
• Ana Sifuentes Laboratorio de Biotecnología Animal, Centro de Biotecnología Genómica, Instituto Politécnico Nacional, Reynosa, Tamaulipas, México https://orcid.org/0000-0002-3867-9886
• Francisco Paredes Universidad Autónoma de Tamaulipas. IA-UAM, Mante, Tamaulipas, México https://orcid.org/0000-0003-2661-6607
• Nicolás Maldonado INIFAP-Campo Experimental Las Huastecas. Carretera Tampico-Mante, km 55. Villa Cuauhtémoc, Altamira, Tamaulipas, México https://orcid.org/0000-0002-2245-0884
• Homar Gill Laboratorio de Biotecnología Vegetal, Centro de Biotecnología Genómica, Instituto Politécnico Nacional, Reynosa, Tamaulipas, México https://orcid.org/0000-0002-3357-2940

Palavras-chave: grão de soja, lipoxigenase, genes Lox, polimorfismos de nucleotídeo único

Resumo

As enzimas lipoxigenases codificadas pelos genes Lox1, Lox2 e Lox3 desempenham um papel crucial na grão de soja, particularmente no desenvolvimento de sabores estranhos. Compreender a variação molecular dentro dos genes Lox é essencial para a melhoria das características organolépticas da soja. Este trabalho visou pesquisar a variação genética nas regiões internas dos genes Lox1, Lox2 e Lox3 em grãos maduros de variedades de soja cultivadas comercialmente no México. O DNA genômico de um painel diversificado de variedades mexicanas de soja foi analisado usando técnicas de ressequenciamento e análise in silico. Foram identificados y caracterizados polimorfismos de nucleotídeo único (SNP) nos genes Lox1, Lox2 e Lox3. Os resultados indicaram que o gene Lox3 apresentou menor variabilidade genética em comparação com os genes Lox1 e Lox2, especificamente, um total de 26 SNPs no gene Lox1, 11 SNPs no gene Lox2 e 5 SNPs no gene Lox3 foram identificados entre as variedades examinadas. Uma variante SNP não-sinônima do genótipo C/C localizada no exon 6 do gene Lox2 foi associada a um efeito desestabilizador na enzima lipoxigenase 2 nas variedades Guayparime S-10 e Huasteca 300. Estes interesantes ressultados proporcionam informações sobre a variação molecular dos genes associadas a lipoxigenases nas variedades mexicanas de soja.

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