Variación molecular de genes asociados a lipoxigenasas en grano de variedades de soya comercial mexicana

• Mónica López Laboratorio de Biotecnología Vegetal, Centro de Biotecnología Genómica, Instituto Politécnico Nacional, Reynosa, Tamaulipas, México https://orcid.org/0000-0002-3921-4335
• Ana Sifuentes Laboratorio de Biotecnología Animal, Centro de Biotecnología Genómica, Instituto Politécnico Nacional, Reynosa, Tamaulipas, México https://orcid.org/0000-0002-3867-9886
• Francisco Paredes Universidad Autónoma de Tamaulipas. IA-UAM, Mante, Tamaulipas, México https://orcid.org/0000-0003-2661-6607
• Nicolás Maldonado INIFAP-Campo Experimental Las Huastecas. Carretera Tampico-Mante, km 55. Villa Cuauhtémoc, Altamira, Tamaulipas, México https://orcid.org/0000-0002-2245-0884
• Homar Gill Laboratorio de Biotecnología Vegetal, Centro de Biotecnología Genómica, Instituto Politécnico Nacional, Reynosa, Tamaulipas, México https://orcid.org/0000-0002-3357-2940

Palabras clave: grano de soya, lipoxigenasa, genes Lox, polimorfismos de un solo nucleotido

Resumen

Las enzimas lipoxigenasas codificadas por los genes Lox1, Lox2 y Lox3 desempeñan un papel crucial en el grano de soya, particularmente en el desarrollo de sabores desagradables. Comprender la variación molecular dentro de los genes Lox es esencial para el mejoramiento de las caracteristicas organolepticas de la soya. Este estudio investigó la variación genética en las regiones internas de los genes Lox1, Lox2 y Lox3 en grano maduro de variedades de soya cultivados comercialmente en México. Se analizó el ADN genómico de un panel diverso de variedades de soya mexicanas mediante técnicas de resecuenciación y análisis in silico. Se identificaron y caracterizaron polimorfismos de un solo nucleótido (SNP) dentro de los genes Lox1, Lox2 y Lox3. Los hallazgos indicaron que el gen Lox3 mostró una menor variabilidad genética en comparación con los genes Lox1 y Lox2; específicamente, fueron identificados un total de 26 SNPs en el gen Lox1, 11 SNPs en el gen Lox2 y 5 SNPs en el gen Lox3 entre las variedades examinadas. Un SNP no sinónimo variante del genotipo C/C ubicado en el exón 6 del gen Lox2, fue asociado con un efecto desestabilizador en la enzima lipoxigenasa 2 en las variedades Guayparime S-10 y Huasteca 300. Estos hallazgos proporcionan información sobre la variación molecular de los genes asociados a las lipoxigenasas en variedades de soya mexicanas.

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