Explorando la genética de tres poblaciones de la raza Cerdo Pelón en México

• Gilberto Lemus Doctorado en Ciencias Biológico Agropecuarias, Universidad Autónoma de Nayarit. Doctorado en Ciencias Biológico Agropecuarias en el Área de Ciencias Zootécnicas y Veterinarias. Universidad Autónoma de Nayarit, Mexico. https://orcid.org/0000-0003-2451-1940
• Javier Rodríguez Centro Nayarita de Innovación y Transferencia de la Tecnología A.C. Tepic, Nayarit-México. https://orcid.org/0000-0001-6380-504X
• William Burgos Corporación Colombiana de Investigación Agropecuaria- AGROSAVIA. Centro de Investigación Turipaná, km 14 vía Montería Cereté, Córdoba, Colombia. https://orcid.org/0000-0001-6560-4233
• Clemente Lemus Universidad Autónoma de Nayarit. Unidad Académica de Medicina Veterinaria y Zootecnia. Compostela, Nayarit- México. https://orcid.org/0000-0002-5120-6805
• Carlos Carmona Universidad Autónoma de Nayarit. Unidad Académica de Medicina Veterinaria y Zootecnia. Compostela, Nayarit- México. https://orcid.org/0000-0002-7587-0946

Palabras clave: diversidad genética, genética del paisaje, razas nativas, recursos genéticos

Resumen

El objetivo de esta investigación fue realizar una caracterización genética molecular de tres poblaciones de Cerdo Pelón (CP) ubicadas en México en los estados de Nayarit, Oaxaca y Yucatán para identificar variaciones, efectos de selección y relaciones genéticas poblacionales. Se genotiparon con éxito un total de 163 animales de tres poblaciones de CP. Se emplearon datos de los SNP genotipados para calcular la diversidad genética, la estructura de la población y el análisis genético-espacial. Los parámetros de frecuencia de alelo menor (MAF), heterocigosidad observada (Ho) y el índice de fijación de Wright (FIS) señalaron que la población de Nayarit es la de mayor diversidad genética (MAF: 0.362, Ho: 0.336, FIS: 0.061). El Análisis de Componentes Principales (ACP) y el análisis filogenético mostraron una diversificación entre las tres poblaciones de CP y señalaron una relación genética estrecha entre las poblaciones de CP y la raza de cerdo ibérico. El análisis de Admixture mostró también una ascendencia compartida de razas comerciales e ibéricas en las poblaciones de CP. En el análisis genético-espacial los resultados describieron un patrón de distribución de las ubicaciones geográficas en relación con las distancias genéticas similar al patrón de agrupamiento del ACP y del análisis del árbol filogenético. Los resultados obtenidos logran presentar el mal estado de conservación del CP y la necesidad de establecer un programa de conservación genética que signifique un esfuerzo para evitar la pérdida de un importante recurso cultural, natural y genético.

Citas

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