Estudo molecular da variedade “Escoba Blanca” do Sesamum indicum L. usado no Paraguai
Resumo
A alta qualidade das sementes de gergelim originárias do país fez com que o Paraguai estivesse entre os principais exportadores. Das variedades disponíveis no território paraguaio, a mais difundida é a ‘Escoba Blanca’, que, possivelmente pelo processo de multiplicação, poderia promover alterações na sua frequência alélica, diversidade e pureza genética. Este trabalho foi realizado com o objetivo de determinar a diferenciação genética entre 50 populações/canteiros/bancos de sete empresas paraguaias que coletam gergelim 'Escoba Blanca', utilizando marcadores microssatélites. Estes sete bancos/empresas/cooperativas coletam e representam amostras de todos os produtores/sementeiros localizados em diferentes departamentos da Região Leste e Oeste (Chaco) do país, com os quais trabalham, comercializam e coletam gergelim. Foi obtido tecido vegetal para extração de DNA, de mudas plantadas especialmente para esse fim, utilizando todas as amostras/acessos incluídos. Foram utilizados seis marcadores microssatélites: GBssrsa184, GBssrsa123, GBssrsa182, GBssrsa108, GBssrsa08 e GBssrsa72. Foram calculados: número e frequência de alelos, distância/agrupamentos, diferenciação entre populações e sua estrutura genética. O número médio de alelos por locus variou de 1,33 a 3,00. Nos marcadores GBssrsa184 e GBssrsa108, três populações apresentaram maior frequência de alelos. As populações examinadas exibiram amplo grau de diferenciação genética entre si, com identificação de quatro grupos, com maior e menor pureza respectivamente.
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Referências
Alda, J., Marcos-Merino, J., & Gallego, R. (2019). Extracción de ADN con material cotidiano: desarrollo de una estrategia interdisciplinar a partir de sus fundamentos científicos. Educación Química, 30(1), 58-69. https://doi.org/10.22201/fq.18708404e.2019.1.65732
Ali, G. M., Yasumoto, S., & Seki-Katsuta, M. (2007). Assessment of genetic diversity in sesame (Sesamum indicum L.) detected by amplified fragment length polymorphism markers. Electronic Journal of Biotechnology, 10(1), 12-23. https://www.scielo.cl/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0717-34582007000100002&lng=es&nrm=iso
Angulo, L., Perichi, G. A., Castro, L. D., & Figueroa, R. (2020). Comparación de diferentes métodos de extracción de ADN genómico en babosas plagas (mollusca: gasterópoda). Revista Científica ECOCIENCIA, 7(4), 35-49. https://doi.org/10.21855/ecociencia.74.380
Arriel, N. H. C., Di Mauro, A., Di Mauro S., Bakke, O. A., Unêda-Trevisoli, S., Costa, M., Capeloto, A., & Corrado, A. R. (2006). Técnicas multivariadas na determinação da diversidade genética em gergelim usando marcadores RAPD. Pesquisa Agropecuária Brasileira, 41(5), 801-809. https://doi.org/10.1590/S0100-204X2006000500012
Cho, Y.I., Park, J.H., Lee, C.W., Ra, W.H., Chung, J.W., Lee, J.R., Ma, K.H., Lee, S.Y., Lee, K.S., Lee, M.C., & Park, Y.J. (2011). Evaluation of the genetic diversity and population structure of sesame (Sesamum indicum L.) using microsatellite markers. Genes & Genomics, 33(2), 187–195. https://doi.org/10.1007/s13258-010-0130-6
Dar, A. A., Mudigunda, S, Mittal, P. K., & Arumugam, N. (2017) Comparative assessment of genetic diversity in Sesamum indicum L. using RAPD and SSR markers. 3 Biotech, 7(10), 1-12. https://doi.org/10.1007/s13205-016-0578-4
Dossa, K., Wei, X., Zhang, Y., Fonceka, D., Yang, W., Diouf, D., Liao, B., Cissé, N., & Zhang, X. (2016). Analysis of genetic diversity and population structure of sesame accessions from Africa and Asia as major centers of its cultivation. Genes, 7(4), 1-13. https://doi.org/10.3390/genes7040014
Gediya, L., Patel, D., Kumar, S., Kumar, P., Parmar, D., & Patel, S. (2019). Phenotypic variability, path analysis and molecular diversity analysis in chickpea (Cicer arietinum L.). Vegetos, 32(2), 167-180. https://doi.org/10.1007/s42535-019-00020-9
González, A., & Causarano, H. (2014). Destino del nitrógeno aplicado en un cultivo de sésamo (Sesamum indicum L.) en un suelo degradado de Paraguay. Acta Agronómica, 63(3), 253-261. https://doi.org/10.15446/acag.v63n3.42259
Laurentin, H., & Karlovsky, P. (2006). Genetic relationship and diversity in a sesame (Sesamum indicum L.) germplasm collection using amplified fragment length polymorphism (AFLP). BMC Genetics, 7(1), 1–10. https://doi.org/10.1186/1471-2156-7-10
Martínez-López, O. R. (2017). El Pampa Chaqueño: raza bovina local del Paraguay. Argumentos técnicos y científicos que sustentan su reconocimiento como raza local. Artes Gráficas Visual. https://isbn.bibliotecanacional.gov.py/catalogo.php?mode=detalle&nt=11326
Martínez-López, O. R., Barbosa, S., Martínez, A. M, Delgado, J. V., & Landi, V. (2019a). Distancias genéticas entre dos poblaciones de bovinos criollos paraguayos. AICA, 14,126-136. https://www.aicarevista.com/n%C3%BAmeros/vol%C3%BAmen-14-2019/
Martínez-López, O. R., Barbosa, S., Martínez, A. M., Delgado, J. V., & Landi, V. (2019b). Perfil genético de dos poblaciones bovinas criollas de Paraguay. AICA, 14, 141-153. https://www.aicarevista.com/n%C3%BAmeros/vol%C3%BAmen-14-2019/
Melgarejo, M., Galeano, A., Amarilla, D., Maidana, E., Bogado, M., Franco, R., Mendoza, M., Colman, P., Silvero, O., Lugo, W., & Da Silva, M. (2020). Efecto de diferentes densidades de siembra sobre las características agronómicas del ajonjolí (Sesamum indicum L.) en el distrito de Curuguaty. Idesia (Arica), 38(3), 107-112. https://dx.doi.org/10.4067/S0718-34292020000300107
Nei, M., & Takezaki, N. (1996). The root of the phylogenetic tree of human populations. Molecular Biology and Evolution, 13(1), 170-177. https://doi.org/10.1093/oxfordjournals.molbev.a025553
Nyongesa, B., Were, B., Gudu, S., Dangasuk, O., & Onkware, A. (2013). Genetic diversity in cultivated sesame (Sesamum indicum L.) and related wild species in East Africa. Journal of Crop Science and Biotechnology, 16(1), 9-15. https://doi.org/10.1007/s12892-012-0114-y
Pandey, S., Das, A., Rai, P., & Dasgupta, T. (2015). Morphological and genetic diversity assessment of sesame (Sesamum indicum L.) accessions differing in origin. Physiology and Molecular Biology of Plants, 21(4), 519-529. https://doi.org/10.1007/s12298-015-0322-2
Pham, T. (2011). Analyses of Genetic Diversity and Desirable Traits in Sesame (Sesamum indicum L., Pedaliaceae): Implication for Breeding and Conservation [Doctoral Thesis, Swedish University of Agricultural Sciences]. https://res.slu.se/id/publ/33897
Rabery, S., Enciso, V., Franco, R., & Lezcano, J. (2020). Incidencia del riego complementario en el rendimiento de granos de sésamo (Sesamun indicum L.). Investigación Agraria, 22(2), 75-81. https://doi.org/10.18004/investig.agrar.2020.diciembre.2202642
Suazo, T., Miranda, S., Rivers, E., Lacayo, M., & Tenorio, D. (2020). Evaluación de metodologías de extracción de ADN de plantas recalcitrantes. Revista Torreón Universitario, 9(24), 45-57. https://doi.org/10.5377/torreon.v9i24.9723
Surapaneni, M., Yepuri, V., Vemireddy, R., Ghanta, A., & Siddiq, E. (2014). Development and characterization of microsatellite markers in Indian sesame (Sesamum indicum L.). Molecular Breeding, 34(3), 1185-1200. https://doi.org/10.1007/s11032-014-0109-0
Teklu, D., Shimelis, H., Tesfaye, A., Mashilo, J., Zhang, X., Zhang, Y., Dossa, K., & Shayanowako, A. (2021). Genetic variability and population structure of Ethiopian sesame (Sesamum indicum L.) germplasm assessed through phenotypic traits and simple sequence repeats markers. Plants, 10(6), 1129. https://doi.org/10.3390/plants10061129
Teklu, D., Shimelis, H., Tesfaye, A., & Shayanowako, A. (2022). Analyses of genetic diversity and population structure of sesame (Sesamum indicum L.) germplasm collections through seed oil and fatty acid compositions and SSR markers. Journal of Food Composition and Analysis, 110(104545),1-12. https://doi.org/10.1016/j.jfca.2022.104545
Zhang, J., Yang, J., Lv, Y., Zhang, X., Xia, C., Zhao, H., & Wen, C. (2023). Genetic diversity analysis and variety identification using SSR and SNP markers in melon. BMC Plant Biology, 23(39), 2-10. https://doi.org/10.1186/s12870-023-04056-7
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